波纹鳜线粒体基因克隆及系统发育信息分析

作者：杨丹丹; 谢永广; 宾石玉; 罗华辉; 安苗; 陈敦学

来源：广西师范大学学报(自然科学版), 2019, (04): 119-126.

DOI：10.16088/j.issn.1001-6600.2019.04.015

• 波纹鳜
• 线粒体基因组
• 碱基偏好性
• 适应性
• 系统进化 Siniperca undulata
• mitochondrial
• codon preference
• informative efficiencies
• phylogeny

为了探讨鳜类线粒体基因组结构特征及系统发育信息,以期为鳜类遗传学研究和分子标记提供参考依据,本文将波纹鳜Siniperca undulata线粒体随机切割成长度为1～3 kb的15个片段,采用PCR产物直接测序法获得波纹鳜线粒体全基因组,并提交至NCBI数据库,获得登录号KJ644783。结果分析发现:波纹鳜线粒体包含13个编码蛋白基因、22个tRNA、2个rRNA以及一个超变区(D-loop),基因排列顺序与其他硬骨鱼类似,不存在基因重排现象。整个基因组存在明显的AC偏好性,其中G碱基含量非常低,仅仅为16.23%。系统发育信息分析结果显示,CO1、ND5、CYTB、ND4基因具有较好的进化...

• 单位
  广西师范大学; 生命科学学院; 贵州大学