利用SCoT标记分析花生栽培种×A.chacoensis组合异源多倍化的早期基因组变化

作者：贺梁琼; 熊发前; 钟瑞春; 韩柱强; 李忠; 唐秀梅; 蒋菁; 唐荣华; 何新华

来源：中国农业科学, 2013, (08): 1555-1563.

• SCoT
• 花生
• 功能型标记
• 种间杂交
• 异源多倍化 start codon targeted polymorphism
• peanut
• gene-targeted markers
• interspecific hybridization
• allopolyploidization

【目的】研究花生属异源多倍化过程中基因组变化行为,揭示花生属多倍体进化的分子机制。【方法】采用SCoT标记对四倍体栽培种仲恺花4号和二倍体野生种A.chacoensis的种间杂种F1及早期多倍体世代(S0—S3)基因组变化时间、类型和频率进行分析。【结果】18条SCoT引物共扩增出126个位点,其中多态性位点117个,多态性比率达92.86%,在供试材料中检测出了丰富的DNA多态性;与扩增出的109条亲本条带比较,F1—S3分别丢失亲本条带28、30、10、11和10条,其中,来自父本特异性条带为16、12、7、9和9条,各自新增条带9、3、10、14和8条,说明SCoT产物早在Fl即开始发生变化,变化类型包括亲本条带的丢失、跳跃式继承和新条带的产生,在丢失的亲本条带中以父本条带为主。【结论】ATG翻译起始位点及其侧翼区域在花生种间杂交异源多倍化早期迅速发生广泛而剧烈的变化,其生物学功能可能与多倍体的进化和稳定有关;SCoT标记作为一种简单、有效和实用的新型功能型分子标记技术,可以为花生属及其它物种多倍体进化中基因组遗传变化研究提供技术支持。

• 单位
  广西壮族自治区农业科学院; 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室; 广西大学