丁香假单胞菌变种Pto(AvrB)胁迫下大豆叶片转录组分析

Authors：张雄; 徐鲁荣; 刘思岑; 张镇川; 刘志诚; 耿雪青

Source：大豆科学, 2019, (06): 879-888.

• 大豆
• 丁香假单胞杆菌
• Pto(AvrB)
• RNA-seq
• 差异表达基因 Soybean
• Pseudomonas syringae
• Differential expressed genes

AvrB是丁香假单胞杆菌大豆致病变种分泌的Ⅲ型效应蛋白因子之一,为研究携带异源效应蛋白AvrB的丁香假单胞菌番茄致病变种Pto(AvrB)侵染大豆后的基因转录变化情况,以大豆Williams 82为试验材料,采用RNA-seq技术对不同菌株处理的大豆叶片进行基因表达谱差异分析,探索大豆非寄主病原菌Pseudomonas syringae pv.tomato携带的异源效应蛋白AvrB是否可以增加非寄主病原菌的致病性。结果显示:共得到43 422个序列信息,不同处理间共有序列为37 611个,其中Pto(AvrB)处理组的序列信息最多。根据GO功能分析可以将基因根据功能分为分子功能、细胞成分和生物...

• Institution
  上海交通大学