从烟草上分离的中国番茄曲叶病毒及其卫星DNA全基因组结构特征

作者：李波; 李战彪; 韦茂春; 卢燕回; 廖咏梅; 陈保善; 蒙姣荣

来源：基因组学与应用生物学, 2011, (04): 281-287.

• 中国番茄曲叶病毒
• 烟草
• 双生病毒
• DNA-A
• 卫星DNA

本研究从具有典型曲叶病症状的广西靖西烟草病植株上分离到病毒分离物JX-2,全基因组序列测定结果表明,JX-2DNA-A全长2738个核苷酸,共编码6个开放阅读框架(open reading frames,ORFs),其中病毒链编码AV1(CP)和AV2两个ORFs,互补链编码AC1、AC2、AC3和AC4共4个ORFs。BLAST结果表明,JX-2DNA-A与中国番茄曲叶病毒(Tomato leaf curl China virus,ToLCCNV)各分离物的相似性在93.0%～99.7%之间,其中与ToLCCNV广西番茄分离物ToLCCNV-G32的相似性最高,达99.7%,而与其它双生病毒的同源性均在88.0%以下,表明JX-2是ToLCCNV的一个分离物。基于JX-2和已报道的双生病毒属代表种DNA-A全基因组核苷酸序列构建的系统进化树显示,JX-2与ToLCCNV-G32分离物的亲缘关系最近,并与ToLCCNV其它分离物形成一个分支,而与其它10种双生病毒的亲缘关系均相对较远。利用双生病毒卫星DNAβ的特异性引物β01/β02在JX-2样品中扩增到DNAβ分子(JX-2β),全长为1341个核苷酸,其...

• 单位
  广西工学院