10株猪流行性腹泻病毒序列分析

作者：杨小蓉; 马良; 许磊; 赵晨璐; 周建民

来源：中国兽医杂志, 2019, (07): 34-37.

• 猪流行性腹泻
• S基因
• 序列测定
• 变异分析 Porcine epidemic diarrhea
• S gene
• sequencing
• variation analysis

为了分析2015-2018年北方地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)遗传变异情况,通过RT-PCR分段扩增、测序,获得10株PEDV S基因序列。分析发现,10株S基因核苷酸序列同源性为96.8%～99.4%,推导编码的氨基酸序列同源性为96.5%～99.3%;与参考株核苷酸序列同源性为93.4%～99.5%,与参考株氨基酸序列同源性为92.0%～99.4%。其中,4株序列基因长度均为4 161 nt,编码1 386个氨基酸;6株序列基因长度均为4 158 nt,编码1 385个氨基酸,与目前流行的变异株和经典株CV777相比,这6株S基因推导的氨基酸序列已分别在131位、1 196位出现1个氨基...

• 单位
  北京市